رئیس سازمان بسیج مستضعفین با اشاره به شهادت طلبه بسیجی علی خلیلی گفت : اشکال دستگاه قضا این است که به امر و نهی مانند قضایای شخصی نگاه می کند حال آنکه باید مدعی العموم به عنوان جرم ورود کند چراکه بحث امنیت اخلاقی جامعه مطرح است.

با گذشت سه روز از شهادت علی خلیلی، جانباز ناهی از منکر، بسیاری از رسانه های مدعی اصلاح طلبی و نزدیکی به جریان دولت، حتی از پوشش اصل خبر شهادت وی نیز سر باز زده‌اند.

نماینده مردم تهران با اشاره به شهادت علی خلیلی شهید امر به معروف و نهی از منکر گفت: در صورت حفظ ارزش‌ها و منفور شدن کارهای منکر شاهد چنین اتفاق‌هایی نخواهیم بود.

حامد حجتی از شاعران کشورمان به مناسبت شهادت علی خلیلی طلبه جوانی که در راه امر به معروف و نهی از منکر شهید شد، شعری سروده است.

شهید علی خلیلی ۱۵ روز قبل از شهادت نامه‌ای به رهبر معظم انقلاب نوشت و در آن نسبت به برخی اظهارات که در قبال اقدام خود می‌شنید، واکنش نشان داد.

مادر حجت الاسلام علی خلیلی، جانباز ناهی از منکر چندی پیش خواست تا قوه ‌قضائیه پاسخ دهد که آیا مجازات جرم و اقدامی که فرزندش به خاطر آن از دنیا رفت کافی بوده است؟ این سوال بعد از شهادت علی خلیلی همچنان برای خانواده او بی جواب است.

حدود یک سال پیش در مسجد جامع ازگل بعد از نماز ظهر و عصر؛ خبرنگار ما گفت و گوی و گپ و گفتی با علی خلیلی انجام داد که در ادامه سخنان این شهید بزرگوار را می خوانید؛

پیکر حجت‌الاسلام علی خلیلی شهید ناهی از منکر فردا(سه‌شنبه 5 فروردین) ساعت 9:30 از مسجد فاطمه زهرا(سلام الله علیها) در نارمک به سمت مسجد النبی(صلی الله علیه و آله و سلم) تشییع می‌شود.